Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
R3HDM1Q15032 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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