Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms