Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNGB1Q14028 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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