Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK13Q14004 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK13Q14004 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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