Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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