Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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