Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPM6BQ13491 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms