Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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