Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms