Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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