Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms