Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms