Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms