Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN11Q06124 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms