Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms