Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZNF101-204ENST00000444249 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AP005131.4-202ENST00000590468 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TPT1P10-201ENST00000312966 496 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms