Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH6A1Q02252 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms