Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BEX3Q00994 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms