Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIM1P81133 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms