Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL8P80075 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms