Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX1P78337 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms