Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-24P63145 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms