Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms