Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-21P61565 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms