Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V0D1P61421 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V0D1P61421 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms