Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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