Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF3P61204 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF3P61204 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms