Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCL1P53675 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms