Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNTBP49356 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms