Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PXNP49023 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PXNP49023 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PXNP49023 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms