Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMD8P48556 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMD8P48556 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms