Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ME1P48163 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ME1P48163 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ME1P48163 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ME1P48163 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ME1P48163 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ME1P48163 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms