Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms