Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDF5P43026 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms