Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms