Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms