Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms