Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms