Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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