Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD27P26842 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD27P26842 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms