Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms