Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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APCP25054 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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APCP25054 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
APCP25054 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
APCP25054 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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