Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYN1P17600 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYN1P17600 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYN1P17600 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms