Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACADSP16219 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACADSP16219 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms