Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms