Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCF2P10911 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCF2P10911 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCF2P10911 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCF2P10911 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCF2P10911 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCF2P10911 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms