Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8orf89P0DMQ9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms