Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLA1P09884 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLA1P09884 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLA1P09884 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLA1P09884 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLA1P09884 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLA1P09884 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms