Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOP08100 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms