Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms